復旦創(chuàng)建首個統(tǒng)一標準的心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫

上海復旦大學6日披露，該校專家與歐洲生物信息學研究所等合作，時經(jīng)3年多，創(chuàng)建了全球首個統(tǒng)一標準的心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫。

校方介紹，該研究由復旦大學附屬中山醫(yī)院特聘教授、美國加州大學洛杉磯分校戴衛(wèi)·格芬醫(yī)學院著名心臟病學專家平及其研究團隊，復旦大學附屬中山醫(yī)院心血管病研究所專家葛均波研究團隊及歐洲生物信息學研究所等合作完成。這項研究在心臟蛋白質(zhì)組生物信息學研究方面取得重要進展。研究成果猶如一座橋梁，把原來“分散進行”的心臟生物學基礎研究和臨床心臟醫(yī)學研究兩大領域連為一體。

蛋白質(zhì)是生命的物質(zhì)基礎，是與生命及各種形式的生命活動緊密聯(lián)系在一起的物質(zhì)。如今，越來越多的組學技術(shù)，如基因組學、蛋白質(zhì)組學和代謝組學等研究在心血管生物領域中已廣泛應用，?？茖W家在大規(guī)模蛋白質(zhì)組學研究中已發(fā)現(xiàn)許多新規(guī)律，對解開心臟之謎、解釋心臟細胞在生理或病理狀態(tài)下的運作機制有重要意義。

但是蛋白質(zhì)組學研究仍然受到很多限制，比如，全球現(xiàn)有的蛋白質(zhì)組學研究存在標識、對比參照物不統(tǒng)一等問題，給科學家的深入研究帶來極大不便。全球范圍內(nèi)心血管研究領域的學者急需一個全新的生物數(shù)據(jù)信息平臺，可將多學科的數(shù)據(jù)進行搜集、整合和分析，方便科學家查閱、對比和運用。

在洛杉磯和上海兩地參與該研究的復旦大學附屬中山醫(yī)院心血管病研究所博士李華告訴記者，在全球多中心聯(lián)合下，研究人員創(chuàng)建的全球首個“心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫”是一個全新的全球共享平臺，不僅解決了標識、對比參照物不統(tǒng)一等難題，同時還具有實時更新數(shù)據(jù)的強大功能，可將不同學科間的資源，如蛋白質(zhì)相關(guān)數(shù)據(jù)等，進行整理，并把這些復雜的相關(guān)數(shù)據(jù)進行“僑聯(lián)”，從而有利于研究人員在特定生物背景下從事蛋白信號通路的深入研究。

據(jù)了解，“心臟細胞器蛋白質(zhì)圖譜庫”平臺設有很多已經(jīng)過整合的“重要數(shù)據(jù)”和專為研究人員設計的寬泛、快速鑒定蛋白的搜索引擎;該平臺同時含有一個數(shù)據(jù)庫和一套生物信息工具，可用來整合已知生物醫(yī)學特征(如基因突變及疾病表型等);此外，該平臺還是一個統(tǒng)一的“實時在線”的基礎門戶網(wǎng)站，可服務于全球不同心血管研究中心學者之間進行合作以及遠程數(shù)據(jù)管理，加速心血管生物學和醫(yī)學領域的知識構(gòu)建進程。

（責任編輯：zxwq）