主要有以下手術方法。
1．內(nèi)口縫合藥物脫管法
按肛瘺術前常規(guī)準備，在腰麻下。充分暴露內(nèi)口位置，以內(nèi)口為中心作一縱行或橢圓形切開，顯露原發(fā)灶，用小刮匙搔刮灶內(nèi)炎癥性及壞死組織，徹底清除感染的肛竇、肛腺、肛腺導管和肌間病變組織。然后用0號腸線間斷縫合創(chuàng)口下方的內(nèi)括約肌。充分封鎖瘺道內(nèi)側端。再將內(nèi)口上方宜腸粘膜剝離下拉。覆蓋內(nèi)口，用1號絲線將粘膜瓣與肛管皮膚縫合數(shù)，以加強內(nèi)口封閉覆蓋，使腸腔內(nèi)容物無隙可入。接著用小刮匙從外口伸入主瘺道或死腔，搔刮腔內(nèi)組織。最后分別從主支管插入細管灌注脫管藥物，讓管道分著藥后抽出，注入藥物，或者根據(jù)管道大小及深淺選擇適當?shù)乃幠斫?jīng)外口插入管道，外端留0.5cm長捻，以便更換時取出。將凡士林紗布置于肛內(nèi)，覆蓋內(nèi)口，包扎固定。
2．內(nèi)口封閉管道引流法
按術前常規(guī)處置準備，充分暴露內(nèi)口。如內(nèi)口與原發(fā)灶在后方的肛瘺，則由肛門后括約肌三角入路，直接清除原發(fā)灶、主管道及內(nèi)口，用剝離下拉的內(nèi)口下緣的直腸粘膜覆蓋內(nèi)口，然后將清除后的主管縫合，閉鎖管道，同時切除或搔刮外口與支管，用組織充填創(chuàng)腔與竇道。而內(nèi)口與原發(fā)灶在側位或前位的肛瘺除由原發(fā)灶所處部位的肛管外緣切皮入路外，其它同上法，內(nèi)口外敷凡士林紗條，包扎固定。
3．曠置加切開或掛線術(開窗術)
按常規(guī)術前處置準備，找到內(nèi)口，然后在復雜性肛瘺主管緊靠肛門緣處開一窗，即造一口，以隔斷此窗以外的管道或空腔感染源。開窗直徑不小于1cm，以充分引流為原則。肛緣處的主管不切開曠置，對管腔進行搔刮，清除感染病灶，剪除外口增生組織，在支管與竇道開窗處，掛入橡皮筋呈松弛狀態(tài)。開窗可不止一個，再根據(jù)術前對瘺管分泌物的細菌培養(yǎng)和藥敏試驗，選用敏感藥液進行沖洗。對開窗與內(nèi)口之間的管道進行切開，至齒線向上延長0.5cm；對肛緣齒線這段敞開的管道作充分擴創(chuàng)，徹底清除感染的肛隱窩；對波及括約肌深層和恥骨直腸肌的管道及齒線上方肌間管道掛橡皮筋，視病情決定松緊度。內(nèi)外敷凡士林紗條。包扎固定。
4．肛瘺手術的注意點：
(1)單純性低位肛瘺，此類肛瘺較為常見，內(nèi)口多與外口相對應，切口應呈放射狀。
(2)高位肛瘺管道穿越外括約肌深層以上，切口選擇同上，切口應視直腸環(huán)是否纖維化；若已纖維化可切開引流。無纖維化者，高位管道部分給予掛線，以防肛門失禁。
(3)馬蹄型肛瘺，此類肛瘺病變范圍廣，管道深且彎曲，穿越肛尾韌帶的上方，宜采用弧行切口，主管道作放射狀切口引流。高位管道處理原則同高位肛瘺。
5．肛瘺手術的切口處理：
(1)弧形切口應距離肛緣1.5cm以上，防止愈合后環(huán)形瘢痕影響肛門功能。
(2)外管道切口應與外括約肌垂直，不宜作斜形切口，以免引流不暢，影響創(chuàng)口愈合。
(3)全層縫合，主管道開放引流，其余創(chuàng)口在病灶清創(chuàng)后給予全層縫合，不留死腔、異物，以保證縫合創(chuàng)口的一期愈合。
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